Родился 5 ноября 1923 года в селе Борщаговка (Киевская область Украины). Окончил сельскую школу. С 4 января 1941 года в рядах Красной Армии, призван Октябрьским РВК (города Киева). В 1942 году окончил Армавирскую военную авиационную школу лётчиков. Служил пилотом в 14-м ЗИАП ВВС Московского военного округа (город Рыбинск, Ярославская область). 14 апреля 1943 года был направлен в 31-й ИАП, который в 4-м ЗИАП Московского военного округа (город Моршанск) переучивался на новую технику.

С 24 мая 1943 года сержант И. А. Шпаченко в действующей армии. Воевал в составе 31-го ИАП (295-я ИАД), где прошёл путь от рядового пилота до командира звена. Сражался на Юго-Западном и 3-м Украинском фронтах. 14 июня 1943 года был сбит в воздушном бою, ранен в руку и ногу, выбросился из горящего самолёта на парашюте. Вскоре вернулся в полк и продолжил боевую работу. Летал на Ла-5.

К сентябрю 1944 года командир звена 31-го истребительного авиационного полка (295-я истребительная авиационная дивизия, 9-й смешанный авиационный корпус, 17-я Воздушная армия, 3-й Украинский фронт) старший лейтенант И. А. Шпаченко совершил 277 боевых вылета, в 46 воздушных боях сбил лично 8 самолётов противника. 15 сентября 1944 года направлен заместителем командира эскадрильи в 913-й ИАП (32-я ИАД, 9-я Воздушная армия, Дальневосточный фронт), где летал на Як-7Б.

Участник  Советско-Японской войны  с 9 августа по 3 сентября 1945 года  в должности  командира эскадрильи  913-го ИАП  (250-я ИАД, 9-я Воздушная армия, 1-й Дальневосточный фронт). Совершил 4 боевых вылета на Ла-7, воздушных побед не имел.

После окончания боевых действий продолжал служить на различных должностях в ВВС. С 27 апреля 1967 года полковник И. А. Шпаченко - в отставке.

Награждён орденами: Красного Знамени (30.05.1944, 20.09.1944), Отечественной войны 1-й степени (18.07.1943), Отечественной войны 2-й степени (29.08.1945), Красной Звезды (30.12.1956); медалями, в том числе "За боевые заслуги" (17.05.1951).