Родился 24 января 1915 года в городе Омске (ныне административный центр Омской области). Окончил среднюю школу. С 25 ноября 1937 года в рядах Красной Армии, призван Пролетарским РВК (города Москвы). Окончил военную авиационную школу лётчиков. Служил в строевых частях ВВС.

Участник Советско-Финляндской войны с 30 ноября 1939 по январь 1940 гг. в составе 68-го ИАП (59-я ИАБР, ВВС 7-й Армии), с 9 января по 13 марта 1940 года уже в 152-м ИАП (ВВС 9-й Армии, Северо-Западный фронт), летал на И-153, воздушных побед не имел.

С 22 июня 1941 года младший лейтенант М. И. Филиппов в действующей армии. Войну встретил в 27-м ИАП (6-го ИАК ПВО, Московской зоны ПВО), летал на И-16. Однако, уже 23 июня был отправлен по болезни в госпиталь (ИАМ ВВС КА). С 8 июля 1941 года воевал уже в 178-м ИАП (Московской зоны ПВО), где продолжал летать на И-16. Осуществлял прикрытие города и военных объектов Москвы с воздуха, помимо выполнения задач ПВО, вылетал на прикрытие наземных войск и штурмовку войск противника. В боях за Москву совершил 72 боевых вылета.

С 20 августа 1942 года воевал в 11-м ИАП (268-й ИАД, 8-й Воздушной армии) на Сталинградском фронте. Совершил 37 боевых вылетов на Як-1. 25 сентября 1942 года в воздушном бою был тяжело ранен в голову, отправлен на лечение в госпитале.

После выздоровления, старший лейтенант М. И. Филиппов был направлен на должность заместителя командира эскадрильи в 43-й ИАП. С 1 сентября 1943 года приступил к боевой работе на Южном фронте, который 20 октября 1943 года был переименован в 4-й Украинский фронт (в составе 278-й ИАД, 3-го ИАК, 8-й Воздушной армии), летая на Як-9Т. В боях за Мелитополь был легко ранен. К 24 октября 1943 года совершил ещё 49 боевых вылетов. С 13 мая 1944 года боевой работы не вёл: полк находился в Резерве Ставки ВГК и проходил переформирование.

К июлю 1944 года командир эскадрильи 43-го истребительного авиационного полка (278-я истребительная авиационная дивизия, 3-й истребительный авиационный корпус, 1-я Воздушная армия, 3-й Белорусский фронт) старший лейтенант М. И. Филиппов совершил 178 боевых вылетов, провёл около 50 воздушных боёв и сбил лично 7 самолётов противника (в последнем наградном листе говорится о 7 личных и 1 групповой победах). Затем, по состоянию здоровья (после 2-х ранений) был отстранён от лётной работы, служил начальником отдела кадров штаба 319-й ИАД ПВО. 1 сентября 1944 года направлен в резерв 3-го Белорусского фронта, боевой работы больше не вёл.

После окончания войны продолжал служить на различных должностях в ВВС. С 7 января 1956 года майор М. И. Филиппов - в запасе.

Награждён орденами: Красного Знамени (01.11.1943), Отечественной войны 1-й степени (14.06.1945, 11.03.1985), Красной Звезды (21.08.1953); медалями, в том числе "За боевые заслуги" (30.04.1947).