Родился 11 декабря 1918 года в деревне Юрьево (ныне Катангский район Иркутской области). С 1929 года жил в городе Новосибирске. В 1935 году окончил 7 классов, в 1938 году - школу фабрично-заводского ученичества (ФЗУ). Работал токарем в железнодорожном депо станции Новосибирск-Главный, затем на авиационном заводе. Окончил Новосибирский аэроклуб. С марта 1936 года в рядах Красной Армии, призван Новосибирским ОВК. В 1938 году окончил лётную школу ОСОАВИАХИМа в городе Ульяновске (ныне административный центр Ульяновской области). Работал лётчиком-инструктором Новосибирского аэроклуба. 15 сентября 1941 года снова был призван в ряды Красной Армии и отправлен в 3-й УТАП.

Боевую деятельность лейтенант В. В. Харчистов начал 8 сентября 1941 года в составе 681-го НБАП (ВВС 10-й Армии, Западный фронт), летая на У-2. С мая 1942 по февраль 1943 гг. был лётчиком связной эскадрильи 162-го САП (ВВС 5-й Армии, Западный фронт), продолжая летать на У-2. Совершил 118 вылетов на обеспечение связи, ночные бомбовые удары и на разведку войск противника.

В мае 1943 года был направлен в 516-й ИАП (5 февраля 1944 года преобразован в 153-й Гвардейский ИАП), где прошёл путь от рядового лётчика до командира эскадрильи (назначен в октябре 1943 года). Боевую работу начал 5 июля 1943 года на Степном фронте, который 20 октября 1943 года был переименован во 2-й Украинский фронт (в составе 203-й ИАД, 5-й Воздушной армии), летая на Як-1Б. С 1 июня 1944 года боевой работы не вёл: полк находился в резерве на аэродроме Казанешти, проходил переформирование и пополнялся новой техникой (включая некоторое количество Як-7Б и Як-9. С 8 июля 1944 года приступил к боевой работе на 1-м Украинском фронте (в составе 12-й Гвардейской ИАД, 2-й Воздушной армии).

К 11 мая 1945 года командир эскадрильи 153-го Гвардейского истребительного авиационного полка (12-я Гвардейская истребительная авиационная дивизия, 1-й Гвардейский штурмовой авиационный корпус, 2-я Воздушная армия, 1-й Украинский фронт) Гвардии капитан В. В. Харчистов совершил 367 боевых вылетов (из них 118 - на У-2 и 250 - на истребителях, имея главной боевой задачей сопровождение штурмовиков), провёл 50 воздушных боёв и сбил лично 10 самолётов противника. Указом Президиума Верховного Совета СССР от 27 июня 1945 года удостоен звание Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали "Золотая Звезда" (№ 4840).

С 7 августа 1946 года Гвардии майор В. В. Харчистов - в запасе. Работал в НИИ-19 (в настоящее время - Сибирский НИИ авиации имени С. А. Чаплыгина) лётчиком-испытателем и начальником лётно-испытателной базы, затем - заведующим лётной базой Новосибирского аэроклуба. Умер 14 января 1982 года.

Награждён орденами: Ленина (27.06.1945), Красного Знамени (25.08.1943, 17.07.1944), Александра Невского (22.10.1944), Отечественной войны 1-й степени (17.09.1943); медалями, в том числе "За отвагу" (09.04.1942) и "Боевые заслуги" (06.05.1946) .