Родился 29 июля 1923 года в селе Новоселье (ныне Монастырщинский район Смоленской области). Окончил среднюю школу. С 8 февраля 1941 года в рядах Красной Армии, призван Смоленским ОВК. В 1943 году окончил военную авиационную школу лётчиков. Службу начал в 43-й подвижной авиационной ремонтной базе 5-й Воздушной армии. Затем был переведён в 297-й ИАП.

С 7 августа 1943 года младший лейтенант Н. С. Якубов в действующей армии. Воевал в составе 297-го ИАП (302-я ИАД), летал на Ла-5.

16 октября 1943 года лётчик 297-го истребительного авиационного полка (302-я истребительная авиационная дивизия, 4-й истребительный авиационный корпус, 5-я Воздушная армия, 2-й Украинский фронт) младший лейтенант Н. С. Якубов не вернулся с боевого задания, числится пропавшим без вести. К тому времени совершил около 75 боевых вылетов, провёл более 15 воздушных боёв, сбил лично 7 и в составе группы 1 самолёт противника.

Награждён орденом Красного Знамени (26.10.1943).